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Etudes des lésions pulmonaires chez le porc : una analyse symbolique sur des concepts issus de l'approche classique

Fablet, Christelle; Toque, Carole; Bougeard, Stéphanie; Diday, Edwin (2010), Etudes des lésions pulmonaires chez le porc : una analyse symbolique sur des concepts issus de l'approche classique, 42èmes Journées de Statistique, 2010-05, Marseille, France

Type
Communication / Conférence
External document link
http://hal.archives-ouvertes.fr/inria-00494799/fr/
Date
2010
Conference title
42èmes Journées de Statistique
Conference date
2010-05
Conference city
Marseille
Conference country
France
Pages
6
Metadata
Show full item record
Author(s)
Fablet, Christelle
Toque, Carole
Bougeard, Stéphanie
Diday, Edwin
Abstract (FR)
L’objectif de l’étude est de décrire les liens qui peuvent exister entre des variables quantitatives et qualitatives caractérisant les lésions pulmonaires chez les porcs, et plus particulièrement les deux maladies que sont la pneumonie et la pleurésie. Les données présentent une structure emboitée et consistent en 125 élevages comprenant chacun 30 porcs. Une approche classique, nécessitant la création de nombreuses variables agrégées telles que des moyennes et des médianes au niveau des élevages, basée sur l’analyse en composantes principales (ACP) suivie d’une classification ascendante hiérarchique (CAH), conduit à la formation de quatre classes d’élevage. Parallèlement, une analyse de données symboliques dont une ACP, a été conduite principalement sur des variables à valeur histogramme correspondant directement aux fréquences des porcs de chaque élevage. Nous concluons à la pertinence de l’analyse de données symboliques appliquée grâce au logiciel SYR en épidémiologie animale. En particulier, l’analyse de données symboliques permet de prendre en compte la variabilité des données initiales, et les différences entre classes sont identifiées grâce au logiciel qui permet de trier les élevages et les variables sur la base des fréquences de leurs modalités en s’affranchissant de la création de nombreuses variables de synthèse.
Abstract (EN)
The objective is to relate quantitative and qualitative variables describing lung lesions in pigs, especially pneumonia and pleuritis. The data consist of 30 pigs from each of 125 farms. A classical approach involving several aggregated variables at the farm level, based on principal component analyses (PCA) and a hierarchical ascendant classification (HAC), lead to four classes of farms. Then, a symbolic data analysis (SDA) with a PCA was conducted on the resultant histograms. We conclude on the relevance of SDA and the SYR software to veterinary epidemiology. In particular, SDA is able to understand the variability of initial data, and differences between classes are identified by the software’s capability to order farms and variables based on the frequencies of merged categories.
Subjects / Keywords
analyse de données symboliques; logiciel SYR; variables histogrammes; données emboitées; Epidémiologie

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